反向平行鏈

想像兩輛車並排停放，卻朝向相反——一輛向北，一輛向南。DNA 雙螺旋的兩條鏈正是這樣排列的。它們彼此並行，但各自方向相反，這一特性稱為反向平行。

方向來自糖-磷酸骨架，它有兩個不同的端，標記為 5' 和 3'。在雙螺旋中，一條鏈從左到右以 5' 向 3' 延伸，而其搭檔則從右到左以 5' 向 3' 延伸。因此在螺旋的任一處，你旁邊都是一條鏈的 5' 方向與另一條鏈的 3' 方向。

這種排列不只是幾何上的怪癖；它是鹼基正確配對、螺旋保持規則形狀所必需的。只有當兩條鏈頭對尾而非頭對頭取向時，鹼基配對的化學才契合。

反向平行的佈局對 DNA 如何被複製有實際影響。構建新 DNA 的酶只能沿 5' 向 3' 方向添加鹼基，因此兩條鏈無法以完全相同的順暢方式複製——一條連續合成，另一條則以短片段合成、隨後再連接起來。