C 值悖論
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如果說 DNA 是生命的說明書，你大概會猜：越精巧的生物需要越厚的書。C 值悖論正是這樣一個出人意料的發現——事實根本不是如此。每個基因組所含的 DNA 量（即「C 值」）在物種之間劇烈變化，而這種變化無視它們看上去有多複雜。
這個悖論有兩層。第一，兩個複雜程度相近的生物，基因組大小可以相差懸殊——某些單細胞變形蟲攜帶的 DNA 遠多於人類。第二，一個生物的總 DNA 量並不能預測它的基因數目。謎底在我們能夠定序基因組之後才揭開：真核生物的大部分 DNA 根本不是編碼基因的序列，而是內含子、調控區，以及最主要的——重複序列和來自轉座子的 DNA。因此較大的 C 值通常意味著更多的非編碼「填充物」，而不是更多的指令。例如，人類只有約兩萬個蛋白質編碼基因，比某些植物和線蟲還少。
如今生物學家常更傾向用「C 值之謎」這個說法，因為真正的問題已不再是「為什麼 DNA 量不隨複雜程度變化」（我們已知大部分是非編碼的），而是「為什麼非編碼的量差異如此之大，這種差異又是否重要」。它在真實生物學中確實重要，因為多餘的 DNA 仍有代價和影響——影響細胞體積、複製時間，以及那些增添或修剪序列的進化力量。這個悖論是一個永久的提醒：數 DNA 不等於數功能。
單細胞的變形蟲 Polychaos dubium 曾被測出基因組大小超過人類的兩百倍。即便考慮測量誤差，結論依然成立：一個「簡單」的變形蟲在 DNA 量上可以遠超人類，而基因數目卻並不更多。
DNA 量與生物複雜程度脫鉤——這正是 C 值悖論的核心。
一旦把編碼 DNA 與非編碼 DNA 區分開，悖論就化解了：複雜程度大致與受調控的基因使用方式相關，而非與 DNA 的原始數量相關。數基因而非數鹼基對才是更好的參照——而即便是基因數目，也只是複雜程度的不完美替代指標。