X 光繞射與結構解析

單晶 X 光繞射(single-crystal X-ray diffraction)

單晶繞射不把樣品磨碎,而是用一顆雖小卻長得完好的晶體,大約橫跨十分之一到三分之一毫米,黏在細纖維上,安裝成能在 X 光束中轉動。當晶體旋轉,每一族原子晶面在恰好擺進精確布拉格角的那一瞬,射出一個銳利的斑點。收集許多角度後,你就建起完整的三維斑點星座——一張晶體倒晶格的直接照片。

威力就來自那第三個維度。由於斑點在空間中彼此分開,而非塌縮到單一軸上,你能量測數以千計個別反射的強度,每一個都用自己的三個整數 (hkl) 乾淨標記。每個強度給出該反射結構因子振幅的平方。由這份豐富的資料集,你(在解決相位問題之後)還原出電子密度圖,再由圖得到每顆原子的精確位置,鍵長與鍵角可達千分之幾埃。

單晶繞射是以完整原子細節決定晶體結構的黃金標準,也是大多數小分子與蛋白質結構被解出的方法。誠實的瓶頸就寫在名字裡:你需要一顆尺寸與品質都足夠的單晶,而哄它長出來往往是整個計畫最難的部分。有些物質——許多粉末、鍍層與不易結晶的材料——始終長不出好的單晶,這正是你退回粉末法或全散射(對分布函數)分析的時候。

對一個小型有機分子做現代單晶實驗,可能記錄兩萬個反射,簡併後剩幾千個獨立反射,足以定出每顆原子,並把結構精算到鍵長約 0.005 埃的精度。

一顆好晶體給出的獨立資料遠多於粉末——這是通往完整三維結構的路。

長出合適的單晶往往才是真正的限速步驟;雙晶、劈裂或太小的晶體給出的資料解不出來。它不是粉末法的捷徑——而是另一種資料更豐富的實驗。

又称
single-crystal XRDSCXRD單晶繞射