時空分子讀出

分子記錄器把紀錄寫入細胞內的 DNA 或 RNA；讀出端則追問：如何在保留細胞身分與空間位置的前提下復原該紀錄。空間轉錄體學與原位定序方法——多工螢光原位雜交、對擴增轉錄本的原位定序，以及以空間條碼捕捉——能在完整組織切片上、以單細胞或次細胞解析度同時讀取眾多分子種類，而非把組織解離成一個混合池。

與記錄器配對後，這樣的讀出原則上不僅能重建細胞所含的分子，還能重建哪些細胞曾活躍或相連，並由有序的編輯重建其先後順序——把一個大腦轉變為一份密集取樣、可由定序儀解碼的分子紀錄。這是分子記錄計畫的關鍵讀取技術；將其與大規模功能性活動記錄結合仍屬萌芽階段，且時間解析度只能來自那些明確設計為使其編輯有序化的記錄器。