R 基團

當化學家畫出一個分子，並在它旁邊寫上一個簡單的字母 R 時，這個 R 就是一個佔位符——一個表示「此處放某個基團，而我們會嘗試好幾種」的空位。R 基團正是這樣一塊連接在固定骨架上的可變部件，是化學家在不同類似物之間有意更換的那一部分。

更正式地說，R 基團是指連接在恆定內核結構上某一確定連接點處的取代基；符號 R（在有多個空位時記作 R1、R2 等）標出發生變化的位置。以這種方式組織一個系列——在共有骨架上更換一個或幾個 R 基團——正是使構效關係變得可讀的關鍵，因為活性可以針對每個 R 基團列表，從而辨認出起作用的特徵。這種佈局是 R 基團拆解的基礎，而後者是醫藥化學資料被拆分以供分析的標準做法。

這套記號是一種思考工具，而非化學事實：同一個實體分子可以用不止一種方式劃分為骨架與 R 基團，選擇一種合理的拆解方式很重要。把 R 基團當作完全獨立於分子其餘部分來對待也可能產生誤導，因為相鄰基團和內核都會改變某個特定 R 基團的作用。