自由組合定律

想像透過拋硬幣來選搭配：一枚硬幣決定上衣顏色，另一枚硬幣決定褲子顏色。兩次拋擲互不影響，因此四種上衣-褲子組合以相等的比例出現。自由組合定律指出，兩個不同性狀的等位基因是由各自獨立的「拋硬幣」分配進配子的。

孟德爾透過在豌豆雜交中同時追蹤兩個性狀得出了這一結論——例如種子顏色和種子形狀。一個性狀如何遺傳，絲毫不能預示另一個性狀，子代呈現出自由組合所預測的典型9:3:3:1比例。

其物理原因在於：減數分裂時，每一對同源染色體相對於其他每一對都隨機排列和取向。不過有一個重要的限制：該定律只對位於不同染色體上（或位於同一染色體上但相距很遠）的基因嚴格成立。緊鄰而坐的基因往往作為一個整體一起遺傳——這一現象稱為連鎖——其組合遠非獨立。