一个酶家族,承担大部分工作
细胞色素P450酶——CYP——是一类含铁的酶,嵌在肝脏(和肠道)中,承担大部分I相代谢。这个名字源于光谱学上的一个特点:当其血红素铁结合一氧化碳时,复合物在450纳米处强烈吸光。撇开这点冷知识,它们真正做的事是惊人的化学:利用分子氧和电子供应,把单个氧原子插入原本不活泼的C–H键中。
人类有数十个CYP基因,但只有少数几个负责处理大多数药物。其中最重要的单一酶是[[cyp3a4|CYP3A4]],据估计代谢了约半数已上市的小分子药物。其余的——CYP2D6、CYP2C9、CYP2C19、CYP1A2——覆盖大部分剩下的。每个酶的口袋形状和底物偏好不同,这就是为什么两个相似的分子可以经由完全不同的途径被清除。
Typical CYP-catalysed phase I reactions: Aromatic hydroxylation: Ar-H -> Ar-OH Aliphatic hydroxylation: R-CH3 -> R-CH2OH N-dealkylation: R2N-CH3 -> R2N-H + HCHO O-dealkylation: R-O-CH3 -> R-OH + HCHO S-oxidation: R-S-R' -> R-S(=O)-R' Epoxidation: C=C -> epoxide Net effect: a new -OH, -NH or other polar handle is exposed, ready for phase II conjugation.
找出软点
当CYP攻击一个分子时,它会瞄准最容易的位点——一个既足够富电子可以反应、又在酶口袋中物理上可接近的位置。药物化学家把这个脆弱位置称为代谢软点。常见软点包括暴露的甲基、苄位、富电子芳环,以及N-或O-甲基(它们经由脱烷基反应脱落)。