三光子顯微術

以近紅外激發（約 1300 或 1700 奈米）與三光子吸收進行的深部組織光學讀取。其更高階的非線性（激發與強度立方成正比）較雙光子遠更有效地抑制離焦背景，其較長、散射較弱的波長亦達得更遠，使高解析單細胞造影得以穿透整個皮質深度、並進入完整腦中的海馬迴。它是不藉植入式光學元件而讀取更深的主要途徑之一。

代價是激發效率大幅降低，須以低重複率下的高脈衝能量達成，因而有升溫與非線性光損傷之虞；幀率與視野亦相應受限。它是為觸及深度而生、耗能較高的專門方法，而非雙光子造影的常規替代。