從一個燒瓶到一塊板
平行合成是指在許多底物上並排進行*同一個*反應——通常固定一個砌塊，讓第二個砌塊在 24 孔或 96 孔板上變化。由於每個孔共享條件和後處理，一位化學家在一次行動中就能交付幾十個類似物，比串行化學更快地釐清構效關係圖景。它是快速設計–合成–測試循環背後的引擎。
組合化學更進一步，把兩個或更多可變位點組合起來——比如 8 個酸 × 12 個胺 = 96 個醯胺——以充實整個篩選庫。關鍵的設計抉擇在於選哪些砌塊：一組經過深思、多樣且類藥的砌塊，比一組龐大卻冗餘的砌塊教給你的多得多。
設計一個能教會你東西的庫
- 選一個穩健的反應，它要能容忍底物的大幅變化——醯胺偶聯和還原胺化是熱門之選。
- 選擇在大小、親脂性和形狀上覆蓋一定範圍的砌塊，而非彼此近似的複製品。
- 在合成任何東西之前，先對虛擬產物集做類藥性過濾——捨棄預測不溶或活潑的成員。
- 跑這塊板，然後在生物測試前對每個孔進行純化並確認身份（LC-MS）。
當你需要數百萬：DNA 編碼庫
DNA 編碼庫（DEL）把這一想法推向極致：每個小分子都貼上獨特的 DNA 條形碼，於是數十億化合物可以混在一起，在同一管中針對靶點篩選，再通過測序存活下來的 DNA 讀出結合物。它是非凡的篩選倍增器，但化學必須與 DNA 相容（溫和、水相），而且任何命中都必須*脫離* DNA 重新合成並複測，你才能相信它。