核心思想
構效關係（SAR）是分子的樣貌與它對生物系統所產生的作用之間的聯繫。把結構稍作改動——這裡加一個基團，那裡換一個原子——生物活性通常也會隨之變化。構效關係，本質上就是仔細觀察這些變化並從中學習的習慣。
為什麼它重要？因為藥物透過分子識別與藥物靶點相契合而發揮作用——正確的形狀、正確的電荷、正確位置上的氫鍵。構效關係正是化學家在從未直接看到蛋白質的情況下，逆向推斷這種契合的方法。在先導優化過程中，效力的每一次提升都建立在構效關係的推理之上。
構效關係在日常中的體現
設想一個團隊擁有一個骨架——一個共享的核心環系——它能微弱地命中靶點。他們合成了十個近親，每個在某一位置上掛著不同的基團。有些更強，有些更弱，有些則完全失活。把這些結果與結構一一對照，就是在做構效關係。幾週下來，規律浮現：在這裡加氟有幫助，在那裡加大體積基團則不可行。
- 選定一個要變化的結構特徵，同時保持其他一切不變。
- 合成這些類似物，並在一致的活性測定中測量它們的活性。
- 比較結果，提出一條規律，然後在下一輪中檢驗這條規律。