當代謝物才是真正的藥物
代謝並不總是破壞。有時身體的化學作用產生一種活性代謝物——一種仍能結合靶點的產物，偶爾*比*母體藥物結合得更好。若干重磅藥物其實就是某個舊化合物的活性代謝物，被單獨分離並開發。當活性代謝物擁有較長的半衰期時，它可以悄悄地把藥物的作用持續時間延長到遠超母體血藥濃度所暗示的程度。
對藥物化學家而言，活性代謝物既是線索也是麻煩。是線索，因為它揭示了靶點能容忍的一個新化學特徵——可作為構效關係的起點。是麻煩，因為你藥物的*實測*效應可能其實是母體加代謝物的合併效應，這會擾亂乾淨的PK/PD建模。無論如何，你必須鑑定並表徵主要代謝物，而不只是母體。
陰暗面：活性中間體
危險得多的是活性中間體。有時P450氧化產生的不是穩定產物，而是一種轉瞬即逝、親電的物種——環氧化物、醌、醯基葡萄糖醛酸苷、亞硝基化合物——它在化學上*飢渴*。它不離開身體，而是抓住最近的親核體：蛋白質、DNA或細胞自身的防禦。當它與肝臟蛋白共價結合時，結果可能是肝毒性或免疫介導的特異質毒性，而沒有任何標準動物研究能可靠預測。
身體的主要防禦是三肽穀胱甘肽，一種內置的親核體，它犧牲自己在親電體擊中要害之前將其吸收。化學家在實驗室利用這一點：在活性中間體捕獲實驗中，你向微粒體孵育體系加入穀胱甘肽，並用質譜尋找穀胱甘肽加合物。若發現它們，說明你的分子正在產生活性物種——一個值得及早重視的警示信號。