洗牌的兩個來源：自由組合與重組

來源一：染色體的自由組合

在減數第一次分裂時，每個四分體排列好後被拉開。但每對的朝向是隨機的：第1對的母方同源染色體可能朝向一極，而第2對的母方同源染色體卻朝向另一極。每對都獨立地決定，於是母方和父方的染色體在整套染色體中被混合搭配。

這正是孟德爾自由組合定律的細胞學基礎。人類有23對染色體，單個配子可能的染色體組合數為 2²³——約840萬種——這還沒算上交叉互換所增添的那一層。

來源二：染色體內部的交叉互換

交叉互換（見上一篇）在母方與父方染色單體之間交換片段。其效果是構建出部分來自母方、部分來自父方的染色單體——這些等位基因組合是父母任一方的染色體都不曾攜帶的。無論來源如何，等位基因的整體重新洗牌都稱為遺傳重組。

當我們看兩個基因時，如果配子攜帶的等位基因組合與親代繼承到的相同，就稱為親本型；如果交叉互換（或自由組合）產生了新組合，就稱為重組型。統計重組型與親本型的數目，正是本主題其餘部分賴以建立的測量方法。

把兩者合起來

Parent's chromosomes:    A B  (one homolog, both 'capital' alleles)
                         a b  (other homolog, both 'lowercase')

No crossover between A and B:
  gametes are parental → A B  and  a b

Crossover between A and B on two chromatids:
  those chromatids become → A b  and  a B   (recombinant)

A single tetrad with one crossover therefore yields
four gametes:  A B (parental),  a b (parental),
               A b (recombinant), a B (recombinant)

自由組合和交叉互換合在一起，使可能的配子庫變得天文數字般龐大。這種變異是日後自然選擇所作用的原材料——但眼下，我們的目標只是測量它。