大尺度改變與演化的引擎

超越單個字母：拷貝數與結構

至此我們改變的是單個字母和短小區段。但突變可以大得多。[[copy-number-variation|拷貝數變異]]指一整段DNA——有時包含整個基因——被複製或缺失，因而不同的人攜帶不同數目的拷貝。其他結構性改變會把某一段翻轉，或將其移到新的位置。這些大型重排會改變劑量：擁有某基因的兩份拷貝而非一份，或零份而非兩份，會改變其產物的生成量。

突變作為變異的引擎

現在是收穫的時刻。我們認識的每一種突變——同義、錯義、移碼、拷貝數——歸根結底都是[[genetic-variation|遺傳變異]]的來源。沒有突變，每個個體都將是完美的複製品，族群也永遠無法改變。突變是新等位基因唯一的原始來源；而重組只是把突變已經創造出的東西重新洗牌而已。

至關重要的是，突變相對於需求是隨機的。細胞並不會因為某個有益的改變被需要就產生它；突變是盲目發生的，而大多數是中性或有害的。把這種盲目的供給轉化為適應的，是[[gen-natural-selection|自然選擇]]——攜帶不同變異型的生物在生存與繁殖上的差異。突變提出方案，而選擇（連同機遇）做出取捨。

The flow, in one line:

  MUTATION  ->  new alleles  ->  GENETIC VARIATION in a population
                                          |
                          +---------------+---------------+
                          v                               v
                  NATURAL SELECTION                   GENETIC DRIFT
             (favors helpful variants)            (random changes by chance)
                          |                               |
                          +---------------+---------------+
                                          v
                          change in ALLELE FREQUENCY over time
                                          =
                                     EVOLUTION

突變是源泉；選擇與漂變在世代間進行塑造。

為何有害等位基因得以存續

如果選擇會清除有害變異型，它們為何從不徹底消失？因為突變不斷重新製造它們。當新的有害等位基因到來的速率與選擇清除舊者的速率相等時，便達到一種平衡——稱為[[mutation-selection-balance|突變—選擇平衡]]。這正是為何即便強烈不利的等位基因，也會在每個族群中以低頻率徘徊：一股穩定的細流，不斷回填選擇所抽走的部分。