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插入、缺失與移碼災難

添加或移除鹼基,可能會把下游的每一個密碼子都擠出原位。了解為何插入單個字母可能比替換更具破壞性,以及為何移除三個字母比移除一個更溫和。

添加與移除字母

[[insertion|插入]]會向序列中添加一個或多個鹼基;[[deletion|缺失]]則移除一個或多個。與保持總長度不變的替換不同,這些改變會改變字母的總數——而這正是它們之所以可能極具破壞性的原因。其根源在於[[reading-frame|閱讀框]]

核糖體每次讀取三個字母構成的密碼子,從一個固定點開始,從不停下來重新計數。它只是取下一組三個,再取下一組三個。如果你插入或缺失的鹼基數不是三的倍數,那麼該點之後的每個密碼子都會發生移位。這就是[[frameshift-mutation|移碼突變]]

看清閱讀框的移位

Wild type   THE BIG RED CAT ATE THE RAT
            (read in 3-letter words from the left)

1-base insertion of 'X' near the start:
            THE BXI GRE DCA TAT ETH ERA T..
            -> every word after the insert is garbage
            -> a STOP codon usually appears soon -> truncated protein

1-base deletion (remove the 'B'):
            THE IGR EDC ATA TET HER AT.
            -> same disaster: the frame is shifted by one

3-base deletion (remove 'RED', a whole word):
            THE BIG CAT ATE THE RAT
            -> frame preserved! one word lost, the rest reads fine
以英文單詞類比密碼子:移位一格會毀掉下游的一切;移除三的倍數則能保持閱讀框。

為何移碼突變後果如此嚴重

移碼之後,胺基酸序列變得毫無意義,而一個[[gen-stop-codon|終止密碼子]]很快會在新的閱讀框中偶然出現。蛋白質提前結束,通常失去功能——這是典型的[[loss-of-function|功能喪失型]]突變。肌肉萎縮蛋白基因中的許多缺失都是這樣運作的:裘馨氏肌肉失養症在很大程度上由移碼缺失引起,而同一基因的不移碼缺失則往往導致較輕的病型。