全基因體關聯研究，以及「定序你的基因體」意味著什麼

GWAS：在全基因體中掃描關聯

全基因體關聯研究（GWAS）選取一大群人——比如數千名患有某種狀況的人和數千名沒有的人——並在兩組之間比較數百萬個 SNP。對每一個 SNP，它只問一個統計學問題：某個特定字母在一組中是否比在另一組中更常見？那些在病例組中可靠地更頻繁出現的 SNP，會被標記為與該性狀*相關聯*。

GWAS 最適用於複雜性狀——身高、血壓、糖尿病風險——這些性狀沒有哪個單一基因說了算。每個相關聯的 SNP 都只把機率輕輕推動一點點；成百上千個加在一起才決定方向。把一個人所有提高風險的變異累加起來，便得到一個多基因評分，對遺傳傾向的粗略估計。這些評分是跨群體的統計趨勢，而不是對任何一個人命運的預測。

GWAS in one picture (one SNP among millions):

            has 'G'   has 'A'
  Cases      62%        38%
  Controls   41%        59%
                ^ 'G' enriched in cases
  -> SNP flagged as ASSOCIATED with the trait

Reminder: association != cause.
The 'G' may just ride along with the true variant
nearby (its haplotype), and effect size is small.

那麼，「定序你的基因體」究竟意味著什麼？

「定序你的基因體」意味著一台儀器讀出你那約 32 億個字母，再由生物資訊學把它們與參考基因體相比較，產出一份你與參考序列不同之處的清單。那份清單——你個人的那套變異——才是真正的產物。其中大多數差異是與數百萬其他人共有的，單獨看並沒有任何意義。

1. 你的 DNA 被定序、比對到參考基因體，再被精簡成一份你與之不同之處的變異清單。
2. 每個變異都被註釋：它常見還是罕見、在不在基因裡、是無害的還是已知有影響？
3. 少數變異可能有臨床意義；許多則意義不明；一項意外發現還可能浮現出你本來並未在找的東西。
4. 結果描述的是機率與傾向，而非確定性——而且最好在專業人士的協助下解讀。