你的兩個層面
遺傳學小心地把兩個層面分開。你的基因型是你所攜帶的遺傳指令的集合——寫在你DNA中的基因的實際版本。你的表現型則是這些指令連同你的環境與人生經歷共同產生的結果：你可觀察到的特徵，從眼睛顏色到身高再到血型。基因型是配方；表現型是最終端上餐桌的那道菜。
為何要堅持這一區分？因為同一種基因型可以產生不同的表現型，而同一種表現型也可能來自不同的基因型。一株帶有「高」基因的植物，在貧瘠土壤裡仍會長得矮小；兩個人可以都是棕色眼睛，卻攜帶著不同的、隱藏的基因版本。把兩個層面分開，能讓我們對二者都作出清晰的推理。
等位基因：基因的不同版本
這裡是缺失的那一塊拼圖。一個基因在所有人身上並不是單一固定的——它有不同的版本。一個等位基因就是某個基因的某一特定版本。一個控制花色的基因，可能有一個傾向於開紫花的等位基因，和另一個傾向於開白花的等位基因。細究起來，你的基因型就是你攜帶了哪些等位基因；而你的表現型就是這些等位基因幫助構建出的特徵。
在日常的遺傳學寫作中，「基因型」常常僅指我們所關注的某一個基因上的等位基因——例如一株豌豆所攜帶的兩個花色等位基因——而不是整個基因組。具體語境會告訴你，對方指的是整套遺傳構成，還是單個基因的那一份。無論哪種情形，基因型／表現型的二分都成立。
Gene of interest: FLOWER COLOUR
Alleles present: P (purple version)
p (white version)
Genotype → Phenotype (what we see)
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P P → purple flower
P p → purple flower (P version masks p here)
p p → white flower
Same phenotype (purple), two different genotypes: PP and Pp.
The instructions (genotype) and the look (phenotype) are
related, but they are NOT the same layer.