路線設計

路線設計是選定一系列實際反應，把廉價起始原料轉化為目標分子。如果說逆合成是腦力激盪「一個分子可以怎樣被拆開」，那麼路線設計就是敲定一個可行的組裝方案，依據現實約束而非紙面上的優雅來權衡各種選擇。

好的路線要短、產率高、相容性好，但它還必須使用可獲得的試劑、避免危險或不穩定的中間體、可靠地安裝立體中心，並最好把最昂貴的片段留到最後幾步引入，以減少浪費。化學家偏好匯聚式路線——把兩個複雜片段分別製備、在後期再連接——而非冗長的線性序列，因為線性路線臨近末端的失敗會把此前的一切都報廢。

路線設計是反覆迭代且因受眾而異的：最初那條僅為測試交付幾毫克的路線，可能與最終交給製程化學用於生產的路線毫無相似之處。早期路線看重製備類似物的速度和靈活性；後期路線看重成本、安全性、穩健性和法規可接受性，因此一個分子的合成在其生命週期中往往會被重新發明數次。