量測與刺激擾動極限

閉迴路腦機介面並非被動的觀察者。記錄本身便可能擾動系統，透過組織反應，或回饋所引起的注意力捕捉；而更急遽者，刺激會改變你正試圖估計的那個狀態。為傳遞回饋或治療而寫入網路，會在脈衝期間與其後透過刺激假影、可塑性與適應而破壞讀取，因此讀與寫在時間上爭奪同一條通道。這使兩個問題相互耦合，並施加了一道聯合可辨識性的界限：你無法一面強力驅動一個系統，一面又乾淨地觀測它未被驅動時的動力學。

前沿的因應之道，是抗假影的前端電路、讀寫交錯排程，以及把刺激當作已知輸入而非干擾來看待的系統辨識。但仍存在一個不可約的核心，它僅在類比意義上、而非在物理上與海森堡（Heisenberg）相似，其中積極的介入與精確的觀測相互權衡，在雙向系統擴大規模時尤其如此。