梯度折射率透鏡微內視鏡與微型顯微鏡

為在不待光穿透上覆組織的情況下對深部構造進行光學讀取，將梯度折射率（GRIN）棒狀透鏡植入作為中繼，把影像自深處引至表面。搭配頭戴式微型螢光顯微鏡——即僅重數克的微型顯微鏡（miniscope）——可對自由活動動物於海馬迴、杏仁核等深部區域，於數週至數月間進行數百個神經元的單細胞鈣造影。

代價是植入透鏡會損傷目標正上方的一柱組織，並僅提供固定且有限的視野。儘管如此，開源微型顯微鏡平台已使深部、慢性、單細胞造影成為廣泛使用的系統神經科學工具，惟其仍屬動物研究方法，尚無直接的人體對應版。